Tarttoon tuli rautatie pian Narva-Tallinna -yhteyden jälkeen, ja Tarton rautatieasema on Viron vanhimpia, vuodelta 1877. Tartosta rata haarautuu lounaaseen (Valgaan) ja kaakkoon (Koidulaan, alkuaan Petseriin). Aardlan ja Kirsin seisakkeet ovat eteläisiä esikaupunkiseisakkeita.